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在全基因體關聯性研究(Genome-Wide Association Study, GWAS)的分析中
干擾因子(confounder)的控制是重要的課題,其中最重要的干擾因子為族群分層(population stratification)
性狀(trait)或疾病的分布在不同族群中會不一樣,SNP的頻率在不同族群的分布也會不一樣
因此在探討兩者的關係時,若沒有考慮到族群分層,可能會出現偽陽性或偽陰性的結果

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在進行全基因體關聯性研究(Genome-Wide Association Study, GWAS)分析時
quality control的其中一個步驟是排除具有近親關係的個案,以避免研究結果產生偏差
高密度的全基因體定型資料(whole-genome genotype data)提供了機會能夠評估個案間的親綠關係
進而達成這個目的,其概念簡單來說:

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